RTKF предназначен для удаления из реестра Windows бесполезных ("мусорных", Trash) ключей, которые оставляют за собой некоторые программы. Тот факт что ключи эти присутствуют в реестре вашего компьютера даже после удаления программ с помощью специальных деинсталляторов, поставляемых вместе с этими же программами, можно расценивать как засорение реестра вашего компьютера без вашего же ведома.
